Susunan organisasi Badan terdiri atas: a. sekretariat; b. bidang pemerintahan dan pembangunan manusia; c. bidang perekonomian, sumber daya alam, infrastruktur dan kewilayahan; d. bidang perencanaan, pengendalian dan evaluasi pembangunan daerah; dan e. bidang penelitian dan pengembangan.
Database Peraturan BPK merupakan bagian dari pelaksanaan JDIH di lingkungan BPK untuk menyebarluaskan informasi peraturan perundang-undangan dan dokumen hukum secara mudah, cepat, dan akurat kepada para pengguna baik kalangan internal BPK maupun masyarakat